Vsebina

• Datoteka poravnave za vrsto datoteke
• Binarno
• Kaj je CRAM datoteka?
• O datotekah CRAM

Datoteka poravnave za vrsto datoteke

Razvijalec	EBI
Priljubljenost	3.0 (1 Glasovanje)
Kategorija	Podatkovne datoteke
Oblika	Binarni X Binarno Ta datoteka je shranjena v binarni obliki, ki zahteva branje njene vsebine.

Kaj je CRAM datoteka?

Oblika zapisa datoteke s stisnjeno poravnavo, ki jo je razvil EBI, predstavnik Evropskega laboratorija za molekularno biologijo; shrani kratke poravnave za branje zaporedja DNK, ki se generirajo s kratkimi branji, kot so BWA, BBMap in BLAT. Več informacij

Format datoteke CRAM je podoben formatu datoteke Binary Alignment / Map (BAM), vendar ima boljše stiskanje datotek in prestrukturirano binarno obliko, usmerjeno v stolpec. Ko se obseg podatkov poveča na področju genetske programske opreme, je bil format CRAM zasnovan tako, da je zmanjšal odtis podatkov o poravnavi na diskovnih nogah.

Skrajšana poravnava je proces dešifriranja, iz katerega prihaja zaporedje v genomu. To je lahko težavno, ker je referenčni genom precej velik in ne iščete vedno natančnih zadetkov v referenčnem genomu. Skrajšani poravnalniki se uporabljajo za iskanje ogromnih zaporedij za tekme in bližnje tekme. Ker so zaporedja tako velika, je stiskanje, ki ga zagotavljajo formati, kot je CRAM, nujno za vzdrževanje velikosti datotek.

FREE DOWNLOAD Get File Viewer za Android Programi, ki odprejo CRAM datoteke

Windows

Samtools

Posodobljeno 1/11/2016

O datotekah CRAM

Naš cilj je, da vam pomagamo razumeti, kaj je datoteka s pripono * .cram in kako jo odpreti.

Vrsta datoteke s stisnjeno poravnavo, opis oblike datoteke in programi Windows, ki so navedeni na tej strani, je bila individualno raziskana in preverjena s strani skupine FileInfo. Prizadevamo si za 100-odstotno natančnost in objavljamo samo informacije o oblikah datotek, ki smo jih testirali in potrdili.

Če želite predlagati kakršne koli dodatke ali posodobitve te strani, nam to sporočite.